| 都道県名 |
指定地域・島名 |
| 北海道 |
礼文島、利尻島、天売・焼尻、奥尻島、小島 |
| 宮城県 |
大島、出島、江島、網地島、田代島、(字)金華山 |
| 寒風沢島、野々島、桂島、朴島 |
| 山形県 |
飛島 |
| 東京都 |
大島、利島、新島、式根島、神津島、三宅島、御蔵島 |
| 八丈島、八丈青ヶ島、八丈鳥島、父島、母島、青ヶ島 |
| 新潟県 |
粟島、佐渡島 |
| 石川県 |
舳倉島、能登島 |
| 静岡県 |
初島 |
| 愛知県 |
佐久島、日間賀島、篠島 |
| 三重県 |
神島、答志島、菅島、坂手島、渡鹿野島、間崎島 |
| 和歌山県 |
大島 |
| 滋賀県 |
沖島 |
| 兵庫県 |
沼島、淡路島、男鹿島、家島、坊勢島、西島 |
| 島根県 |
隠岐島、島後、中ノ島、西ノ島、知夫里島 |
| 布施村、都万村、五筒村、西郷町 |
| 岡山県 |
鹿久居島、大多府島、頭島、鴻島、犬島、石島、松島 |
| 六口島、高島、白石島、北木島、真鍋島、小飛島、飛島 |
| 六島、神島、走出、有田、大島、前島、長島 |
| 広島県 |
走島、百島、因島、瀬戸田島、細島、佐木島、小佐木島 |
| 鷺島、生野島、大崎上島、長島、芸備群島、三角島 |
| 斎島、大崎下島、豊島、情島、下蒲刈島、上蒲刈島 |
| 豊浜町、阿多田島、江田島、厳島(宮島)、似島、金輪島 |
| 山口県 |
端島、柱島、黒島、情島、浮島、前島、笠佐島、馬島 |
| 久賀前島、平郡島、平郡東、佐合島、祝島、八島 |
| 白井田、溝井、四代、牛島、大水無瀬島、小水無瀬島 |
| 大津島、黒髪島、野島、蓋井島、六連島、角島、見島 |
| 大島、櫃島、相島 |
| 徳島県 |
伊島、出羽島 |
| 香川県 |
直島、屏風島、向島、男木島、女木島、大島、櫃石島 |
| 岩黒島、与島、小与島、京阪フィッシャーマン、本島 |
| 牛島、広島、手島、小手島、笠島、讃岐広島、佐柳島 |
| 高見島、粟島、志々島、伊吹島、小豆島、沖之島 |
| 小豊島、豊島 |
| 愛媛県 |
高井神島、魚島、弓削島、佐島、生名島、岩城島、鵜島 |
| 赤穂根島、津島、伯方島、四阪島、大三島、小大下島 |
| 大下島、岡村島、小島、来島、馬島、比岐島、上浦町 |
| 宮窪町、吉海町、関前村、大島、野忽那島、睦月島 |
| 中島、怒和島、津和地島、二神島、安居島、興居島 |
| 釣島、青島大島、九島、嘉島、戸島、日振島、竹ヶ島 |
| 蛤、百之浦、本九島 |
| 高知県 |
沖の島、鵜来島 |
| 福岡県 |
馬島、藍島、地島、大島、相島、玄界島、小呂島、姫島 |
| 佐賀県 |
高島、神集島、小川島、加唐島、松島、 馬渡島、向島 |
| 長崎県 |
対馬島、海栗島、泊島、赤島、沖ノ島、島山島、壱岐島 |
| 若宮島、原島、長島、大島、黒島、青島、飛島、鷹島 |
| 飛島免、青島免 |
| 大島、度島、高島、的山大島、生月町、宇久島、寺島 |
| 高島、黒島、六島、野崎島、納島、小値賀島、黒島 |
| 大島、斑島、中通島、頭ヶ島、桐ノ小島、若松島、前島 |
| 日ノ島、有福島、漁生浦島、奈留島、久賀島、蕨小島 |
| 椛島、福江島、赤島、黄島、黒島、島山島、嵯峨の島 |
| 嵯峨島、蠣ノ浦大島、江島、崎戸町、大瀬戸町松島 |
| 平島、松島、崎戸町、池島、高島、伊王島 |
| 熊本県 |
湯島、中島、横浦島、牧島、御所浦島、横島 |
| 大分県 |
姫島、地無垢島、保戸島、大入島、大島、屋形島、深島 |
| 宮崎県 |
島野浦島、大島、築島 |
| 鹿児島県 |
長島、獅子島、獅子島、伊唐島、桂島、新島、種子島 |
| 上甑島、中甑島、下甑島、馬毛島、屋久島、口永良部島 |
| 竹島、硫黄島、黒島、口之島、中之島、諏訪之瀬島 |
| 平島、悪石島、小宝島、宝島、奄美大島、徳之島、請島 |
| 沖永良部島、与論島、喜界島、加計呂麻島、与路島 |
| 沖縄県 |
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